Creșterea bruscă a formei mai transmisibile de Omicron ia prin surprindere pe oamenii de știință | Ştiinţă

Pe 7 decembrie 2021, pe măsură ce varianta Omicron a coronavirusului pandemic a început să lovească lumea, oamenii de știință au identificat oficial o tulpină asociată. BA.2 diferă cu aproximativ 40 de mutații față de descendența originală Omicron, BA.1, dar a provocat atât de puține cazuri de COVID-19 încât părea un spectacol secundar pentru omologul său rampant.

„Mă gândeam: „BA.1 are avantajul. Nu vom mai auzi niciodată de BA.2”, își amintește Mark Zeller, epidemiolog genomic la Institutul de Cercetare Scripps. Opt săptămâni mai târziu, el spune: „E clar că nu este cazul. …Sunt destul de sigur [BA.2] va fi peste tot în lume, că va mătura și va fi varianta dominantă în curând în majoritatea țărilor, dacă nu în toate.”

Zeller și alți oameni de știință încearcă acum să înțeleagă de ce explodează BA.2 și ce înseamnă apariția sa pentru creșterea Omicron și pentru pandemia generală. Deja un raport din Marea Britanie publicat săptămâna trecută și un studiu mare de uz casnic din Danemarca, postat săptămâna aceasta, sub formă de preprint, arată clar că BA.2 este în mod inerent mai transmisibil decât BA.1, lăsând oamenii de știință să se întrebe care dintre mutațiile sale distincte conferă un avantaj.

Dar până acum, BA.2 nu pare să îmbolnăvească oamenii decât BA.1, care în sine prezintă un risc mai mic de boală severă decât variante precum Delta și Beta. În Danemarca, unde până la 21 ianuarie BA.2 a reprezentat 65% din cazurile noi de COVID-19, „Observăm o scădere continuă și abruptă a numărului de pacienți din unitatea de terapie intensivă și… acum o scădere a numărului de internări în spital legate de SARS-CoV-2”, spune Tyra Grove Krause, epidemiolog de boli infecțioase la agenția de sănătate publică a țării. De fapt, guvernul danez este atât de încrezător că varianta nu va provoca tulburări majore încât a ridicat aproape toate restricțiile legate de pandemie la 1 februarie.

Cu toate acestea, unii oameni de știință prevăd că BA.2 va extinde impactul lui Omicron. „Bănuiesc că vom vedea [BA.2] a crea o coadă substanțial mai lungă de circulație a Omicronului decât ar fi existat cu doar [BA.1]dar că nu va conduce la amploarea epidemilor pe care le-am experimentat cu Omicron în ianuarie”, biologul computațional Trevor Bedford de la Centrul de Cercetare a Cancerului Fred Hutchinson. a postat pe Twitter pe 28 ianuarie. În Africa de Sud, BA.2 ar putea să oprească deja scăderea rapidă a noilor infecții observată după ce valul Omicron din țară a atins vârful în decembrie 2021.

Deși BA.2 a reprezentat mai puțin de 4% din toate secvențele Omicron din principala bază de date de virusuri la nivel mondial la 30 ianuarie, a fost identificat în 57 de țări, cel mai vechi caz documentat datând din 17 noiembrie în Africa de Sud. Probabil că acum domină în India, potrivit Bijaya Dhakal, un biolog molecular la Laboratorul de referință Sonic din Austin, Texas, care a examinat datele de secvență încărcate din opt state mari indiene. În Regatul Unit, proporția cazurilor probabile de BA.2 s-a dublat de la 2,2% la 4,4% în cele 7 zile care s-au încheiat pe 24 ianuarie.

În Statele Unite, Centrele pentru Controlul și Prevenirea Bolilor nu urmăresc încă BA.2 separat. Dar Bedford estimează că a reprezentat 7% din cazurile noi din SUA la 30 ianuarie, în creștere față de 0,7% la 19 ianuarie. „În fiecare țară și de-a lungul timpului, vedem că rata de creștere a epidemiei a Omicron BA.2 este mai mare decât a Omicron BA.1”, spune el.

Raportul de săptămâna trecută al Agenției pentru Securitatea Sănătății din Regatul Unit (UKHSA) susține această evaluare în Anglia, constatând că BA.2 se răspândea mai repede decât BA.1 în toate regiunile în care erau disponibile suficiente date pentru a face o evaluare. Datele UKHSA arată, de asemenea, că la sfârșitul lunii decembrie 2021 și începutul lunii ianuarie, transmiterea a fost mai mare printre contactele casnice a cazurilor BA.2, la 13,4%, decât la contactele altor cazuri Omicron (10,3%).

Studiul din Danemarca, care secvențiază virusul de la aproape fiecare persoană care ia COVID-19, prezintă o imagine mai dramatică. În gospodăriile în care primul caz a fost BA.1, în medie 29% dintre celelalte persoane din gospodărie s-au infectat. Când primul caz a fost BA.2, 39% dintre membrii gospodăriei erau infectați.

Se știa deja că Omicron are mutații care îl ajută să evite anticorpii, dar cercetătorii danezi au descoperit, de asemenea, că BA.2 poate fi și mai bun la evitarea imunității induse de vaccin: persoanele vaccinate și stimulate erau de trei ori mai susceptibile de a fi infectate cu BA.2. ca la BA.1. Persoanele vaccinate, dar nerapelate, au fost de aproximativ 2,5 ori mai sensibile, iar persoanele nevaccinate de 2,2 ori mai sensibile. Datele timpurii din Marea Britanie, totuși, au arătat că persoanele vaccinate, dacă au fost stimulate, aveau aproximativ același nivel de protecție împotriva infecțiilor simptomatice cu BA.1 sau BA.2—63% și, respectiv, 70%.

Într-o descoperire plină de speranță și neașteptată din Danemarca, cei care au fost vaccinați sau vaccinați și stimulați au transmis BA.2 membrilor gospodăriei mai rar, comparativ cu BA.1. Nu același lucru a fost valabil și pentru persoanele nevaccinate, care au trecut BA.2 persoanelor de contact din gospodărie cu o rată de 2,6 ori mai mare decât au trecut BA.1.

Mulți oameni de știință în urmă cu câteva săptămâni se întrebau dacă o infecție anterioară cu Delta sau o altă variantă ar proteja oamenii de Omicron în general, unii caută acum date despre dacă prima creștere a Omicron a creat un scut împotriva BA.2. „În ce măsură te protejează o infecție cu BA.1 împotriva reinfectării cu BA.2?” întreabă Zeller. „Din ceea ce am văzut în Danemarca, nu va fi 100%.”

Oamenii de știință testează, de asemenea, capacitatea variantei de a evita anticorpii induși de vaccin în studiile de laborator. Și producătorul de medicamente GlaxoSmithKline își testează anticorpul monoclonal, sotrovimab, fabricat cu Vir Biotechnology, împotriva BA.2 în studii de laborator. Este singurul anticorp larg autorizat care încă împiedică BA.1.

Oamenii de știință notează că BA.1 și BA.2 sunt la fel de departe unul de celălalt pe arborele evolutiv, precum variantele anterioare de îngrijorare – Alpha, Beta și Gamma – sunt una de cealaltă (vezi graficul de mai jos). Unii chiar cred că BA.2 nici măcar nu ar trebui să fie considerat Omicron. „Sper că în viitorul apropiat BA.2 va primi propria variantă de preocupare [label] pentru că oamenii presupun că este foarte asemănător cu ceea ce nu este”, spune Zeller.

nu atât de asemănătoare

După cum sugerează această reprezentare a arborelui evolutiv SARS-CoV-2, tulpinile BA.1 și BA.2 ale variantei Omicron sunt la fel de distincte genetic pe cât sunt variantele anterioare Alpha, Beta și Gamma unele de altele.

GISAID/Nextstrain/NCO, adaptat de K. Franklin/Ştiinţă

BA.2 nu are toate mutațiile care ajută BA.1 să evite detectarea imună, dar nu are o parte din frații săi. Thomas Peacock, virolog la Imperial College London, observă că cele mai multe dintre diferențe sunt într-o zonă a proteinei spike, numită domeniul N-terminal (NTD), care găzduiește ținte de anticorpi. „Ceea ce nu știm este: doar pentru că există schimbări, sunt schimbări care chiar fac ceva?” spune Emma Hodcroft, epidemiolog molecular la Universitatea din Berna.

Dar o diferență NTD – o ștergere la aminoacizii 69 și 70 care este prezent în BA.1 și nu în BA.2 – ar putea oferi cercetătorilor un instrument pentru monitorizarea răspândirii tulpinii Omicron. Anumite teste de reacție în lanț a polimerazei SARS-CoV-2 detectează trei secvențe genetice ale virusului, dar mutația din gena NTD a lui BA.1 elimină una dintre aceste ținte. Testele de reacție în lanț a polimerazei preiau toate cele trei ținte din BA.2, oferind un proxy pentru distingerea tulpinilor Omicron dacă nu există o secvență completă a virusului.

Modul în care s-au născut tulpinile de frați îi preocupă și pe oamenii de știință. Evoluția virală la un singur pacient imunocompromis este o teorie, spune Andrew Rambaut, biolog evoluționist la Universitatea din Edinburgh. „Este posibil ca infecția pe termen lung să producă o mulțime de diversitate într-un singur individ. Ar putea fi compartimentat. Deci variante diferite care trăiesc în diferite părți ale corpului.” Ambele tulpini de Omicron ar fi putut evolua și la animale infectate cu SARS-CoV-2 adaptat la om, apoi s-ar fi răspândit înapoi la oameni.

De ce apare BA.2 abia acum este încă un mister, spune Hodcroft. Ea speculează că un factor la fel de simplu precum cel prin care Omicron a surprins un zbor mai devreme din Africa de Sud, unde ambele tulpini au fost identificate pentru prima dată, ar putea fi explicația. „BA.2 s-ar putea să fi fost prins puțin mai mult timp. Dar când a ieșit în sfârșit și a început să se răspândească, a început să demonstreze că își poate depăși sora mai mare.”

Actualizare, 1 februarie, ora 17:05: Această poveste a fost actualizată.

Leave a Comment